تعمل الوزارة على تحقيق الأهداف العامة التالية:

*   رسم السياسة المالية للسلطة الوطنية الفلسطينية  و الإشراف على تنفيذها.

*  الارتقاء بأداء النظام المالي الفلسطيني وبشفافية إدارته إلى أعلى المعايير والمنهجيات المعتمدة دوليا.

*   إدارة الدين الحكومي الداخلي و الخارجي.

*  تحقيق التكامل بين السياسة المالية و السياسة النقدية خدمة للاقتصاد الوطني و ذلك بالتنسيق مع سلطة النقد الفلسطينية و جميع الوزارات و المؤسسات ذات العلاقة.

*   الإشراف على جميع الموارد المالية لخزينة السلطة الوطنية و حفظها و إنفاقها و الرقابة عليها.